15-2-3- تعیین ترادف محصولات………………………………………………………………………………………….. 56
16-2-3- آزمون آماری…………………………………………………………………………………………………………….. 56
فصل چهارم: نتایج
1-4 نتایج جستجوی اینتگرونهای کلاس 1 و 2…………………………………………………………………….. 57
2-4 نتایج بررسی کاست ژنی کلاس 1 اینتگرون‌ها……………………………………………………………….. 63
3-4 نتایج تعیین توالی کاست ژنی کلاس 1 اینتگرون‌ها………………………………………………………. 65
عنوان صفحه
فصل پنجم: بحث و نتیجه گیری…………………………………………………………………………………………… 67
فهرست منابع……………………………………………………………………………………………………………………………. 75
پیوست ………………………………………………………………………………………………………………………………………. 89
فهرست جداول
عنوان صفحه
جدول1-1: طبقه بندی آنتی‌بیوتیک‌ها بر اساس مکانیسم اثر ………………………………………………. 10
جدول 1-3: دستگاهها وسائل آزمایشگاهی مورد استفاده……………………………………………………….. 34
جدول 2-3: مواد شیمیایی مورد استفاده…………………………………………………………………………………. 35
جدول 3-3: آنتی‌بیوتیک‌های استفاده شده برای آنتی‌بیوگرام……………………………………………….. 39
جدول4-3: دیسک‌های آنتی‌بیوتیک استفاده شده، مقادیر ماده موثره آن‌ها
و تفسیر نتایج آزمایش حساسیت آنتی‌بیوتیکی ………………………………………………………………………. 41
جدول 5-3: خصوصیات روش آزمایش آنتی بیوگرام (دیسک دیفیوژن)
بر اساس معیارهای CLSI (NCCLS)…………………………………………………………………………………… 42
جدول 6-3: اطلاعات نمونه های کارشده ، گرفته شده از مزارع گوشتی
شهرستان شیراز…………………………………………………………………………………………………………………………. 45
جدول 7-3: برنامه چرخه حرارتی PCR برای شناسایی ژن های اینتگراز 1 واینتگراز 2…… 50
جدول 8-3: برنامه چرخه حرارتی PCR برای شناسایی کاست ژنی اینتگرون کلاس1 …… 50
جدول9-3: مشخصات مربوط به پرایمرهای مورد استفاده برای شناسایی ژن های
اینتگراز 1 و اینتگراز 2……………………………………………………………………………………………………………… 51
جدول10-3: مشخصات مربوط به پرایمرهای مورد استفاده برای شناسایی کاست ژنی
اینتگرون کلاس 1………………………………………………………………………………………………………………………. 51
جدول11-3: غلظت استوک مواد اولیه مورد استفاده در واکنش زنجیرهای پلیمراز…………….. 51
جدول 12-3: ساخت محلول کار آماده جهت انجام Multiplex PCR برای شناسایی
ژنهای اینتگراز…………………………………………………………………………………………………………………………….. 52
عنوان صفحه
جدول 13-3: تهیه بافر TAE 50 بار………………………………………………………………………………………. 53
جدول14-3: ساخت محلول کار آماده جهت انجام PCR برای شناسایی کاست ژنی
کلاس1 اینتگرون………………………………………………………………………………………………………………………. 55
جدول 1-4: مقاومت های چندگانه آنتی بیوتیکی در جدایه های اشریشیا کولی
بدست آمده از مراحل مختلف نمونه گیری در گله های گوشتی اطراف شیراز…………………….. 58
جدول 2-4: تعداد (درصد) موارد مثبت و منفی ژن اینتگراز1 در جدایه های E. coli
جداشده در سه مرحله مختلف از جوجه های گوشتی……………………………………………………………. 59
جدول 3-4: تعداد (درصد) موارد مثبت و منفی ژن اینتگراز2 در جدایه های E. coli
جداشده در سه مرحله مختلف از جوجه های گوشتی……………………………………………………………. 60
جدول 4-4: تعداد (درصد) موارد مثبت و منفی حضور همزمان ژنهای اینتگراز 1 و 2
در جدایه های E. coli جداشده در سه مرحله مختلف از جوجه های گوشتی……………………. 61
جدول 5-4: تعداد (درصد) موارد مثبت و منفی ژن اینتگراز1 و ژن اینتگراز2 و حضور
همزمان هر دو ژن اینتگراز در تمام جدایه های E. coli مورد بررسی در این مطالعه…………. 62
جدول 6-4: کد نمونه، طول کاست ژنی و ژنهای موجود در کاست ژنی
کلاس 1 اینتگرون‌ها در محصولات PCR تعیین ترادف شده…………………………………………………. 66
فهرست تصاویر
عنوان صفحه
تصویر 1-1 مکانیزم های توسعه مقاومت به آنتی بیوتیک …………………………………………………… 19
تصویر 2-1 سه مکانیسم اصلی که توسط آن ژن های مقاومت آنتی بیوتیکی
به صورت افقی در میان باکتری ها منتقل می‌شوند ………………………………………………………………. 21
تصویر3-1) ساختمان کلی یک اینتگرون ………………………………………………………………………………… 24
تصویر4-1: ساختمان کلی کلاس1 اینتگرون‌ها ……………………………………………………………………… 25
تصویر 5-1: ساختار کلاس 1 اینتگرون یافت شده در Tn402……………………………………………….. 26
تصویر6-1: ساختار اینتگرون کلاس2 موجود در Tn7 …………………………………………………………… 26
تصویر7-1: ساختار اولین اینتگرون کلاس 3 از ژاپن …………………………………………………………….. 27
تصویر8-1: ساختار کاستها همراه اینتگرون ……………………………………………………………………………. 28
این مطلب را هم بخوانید :
تصویر8-1:ساختار شماتیک کاست وارد شده به اینتگرون ……………………………………………………. 29
تصویر9-1: مکانیسم ورود و بیان کاست‌های ژنی توسط اینتگرون کلاس1 ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 31
تصویر1-4: تصوی ژل الکتروفورز……………………………………………………………………………………………….. 63
تصویر 2-4: الگوی باند‌های محصولات PCR کاست ژنی کلاس 1 اینتگرون‌ها
با طول متفاوت پس از الکتروفورز روی ژل آگارز……………………………………………………………………… 64
تصویر 3-4: الگوی باند‌های محصولات PCR کاست ژنی کلاس 1 اینتگرون‌ها
با طول متفاوت پس از از الکتروفورز روی ژل آگارز………………………………………………………………….. 65
فهرست نمودارها
عنوان صفحه
نمودار1-4: درصد مقاومت های چندگانه آنتی بیوتیکی در جدایه های اشریشیا کولی
بدست آمده از مراحل مختلف نمونه گیری در گله های گوشتی اطراف شیراز……………………. 58
نمودار 2-4: نمودار درصد موارد مثبت و منفی ژن اینتگراز 1 در جدایه های E. coli
بدست آمده طی مراحل مختلف نمونه‌گیری در این مطالعه……………………………………………………. 59
نمودار 3-4: نمودار درصد موارد مثبت و منفی ژن اینتگراز 2 در جدایه های E. coli
بدست آمده طی مراحل مختلف نمونه‌گیری در این مطالعه………………………………………………….. 60
