3-10 توالی یابی…………………………….. 56

3-11 انتقال پلاسمید pET-32a (+) حاوی ژن هدف به باکتری BL21 (DE3)……..

3-12 تحریک بیان ژن هدف……………………………… 56

3-13 استخراج پروتئین از باکتری…………………………….. 57

3-14 الکتروفورز پروتئینها به روش SDS-PAGE……………..

3-14-1 مراحل بستن ژل به صورت زیر انجام شد……………..59

3-15 دات بلات……………………………… 61

3-16 محلولها و بافرها…………………………… 62

3-16-1 بافر شستشو یا محلول TBS…………………………….

3-16-2 محلول بلوکه کننده…………………………… 62

3-16-3 بافر شستشو یا محلول TBS-T……………………………..

3-16-4 آنتیبادی اولیه……………………………. 62

3-16-5 آنتیبادی ثانویه……………………………. 62

3-16-6 روش تهیه محلول رنگ آمیزی DAB…………………..

3-17 خالص سازی پروتئین…………………………….64

3-18 آماده سازی آنتی ژن ایمنی زا برای تزریق به مرغ………………….. 64

3-19 ایمنی زائی مرغ‌ها جهت تولید آنتی بادی اختصاصی……………… 65

 

3-19-1 تزریق اولیه…………………………… 65

3-19-2 تزریق‌های ثانویه  (Booster injection)……………………………. 66

3-20 جمع آوری و ذخیره تخم مرغ……………………………. 66

3-21 جداسازی IgY با بهره گرفتن از روش پلی اتیلن گلایکول 14700……………. 66

3-22 بررسی IgY به روش الکتروفورز SDS-PAGE و دات بلات……………… 67

4 نتایج و بحث……………………………… 67

4-1 تعیین نواحی آنتی ژنیک ژن CagA……………………………..

4-2 تایید آلودگی نمونه‌های بیوپسی…………………………….. 69

4-3 تعیین کمیت و کیفیت DNA……………………………..

4-4 بررسی محصولات PCR……………………………..

4-5 خالص سازی محصول PCR……………………………..

4-6 هضم PET32a (+) و ژن CagA……………………………..

4-7 کلونینگ ژن CagA در باکتری DH5α……………………………..

4-8 تأیید صحت قطعه کلونشده در pET32a (+)………………………….

4-9 نتایج کلونی PCR…………………………….

4-10 تایید نتایج کلونی PCR با بهره گرفتن از T7…………………………….

4-11 استخراج پلاسمید و انجام هضم آنزیمی…………………………….. 75

4-12 توالی یابی…………………………….. 76

4-13 آنالیز فیلوژنتیکی توالی آمینواسیدی CagA……………………………..

4-14 بیان ژن……………………………. 78

4-15 SDS-PAGE…………………………….

4-16 دات بلات……………………………… 79

4-18 تولید IgY ضد هلیکو باکتر پیلوری-CagA در زرده تخم مرغ………… 81

این مطلب را هم بخوانید :

5 نتیجه گیری و پیشنهادات……………………………… 85

چکیده:

هلیکوباکتر پیلوری شایع ترین پاتوژن گوارشی است که نیمی از مردم دنیا را آلوده ساخته و مهمترین علت بیماری‌های معده ای-روده ای از جمله گاستریک مزمن، زخم معده و دوازدهه، سرطان معده و لنفوما است.  ژن CagA (سیتوتوکسین مرتبط با ژن A) یکی مهمترین شاخص‌های بیماری زای این باکتری است.  در این مطالعه به منظور همانه سازی بخش‌های آنتی ژنیک ژن CagA و بررسی تولید IgY در زرده تخم مرغ در ابتدا بر اساس برنامه‌های بیوانفورماتیکی قطعه حاوی اپی‌توپ‌های اصلی ژن CagA به طول 996 جفت باز شناسائی شد سپس این قطعه به کمک PCR از ژنوم هلیکوباکتر پیلوری موجود در بیوپسی معده 30 بیمار مبتلا به این باکتری جدا شده و با بهره گرفتن از هضم آنزیمی به ناقل  pET32a و سپس به داخل میزبان‌های کلون سازی و بیانی وارد شد.  نتایج توالی یابی کلونیگ موفق ژن CagA را نشان داد و در نهایت ترکیب پروتئینی بدست آمده توسط روش SDS-PAGE و دات بلات تائید شد. در مرحله بعد ترکیب پروتئینی بدست آمده به 3 مرغ از نژاد HY-LINE تزریق شد. تخم مرغ‌ها به مدت 10 هفته جمع آوری شدند و IgY تولید شده در زرده تخم مرغ آنها با بهره گرفتن از روش SDS-PAGE بررسی و تائید شد.

فصل اول

1- مقدمه

4-2-2  محاسبه فاصله انتظاری…………………………………………………………………………………….64

4-2-3 مدل ریاضی پیشنهادی……………………………………………………………………………………..83

4-2-3-1 مثال……………………………………………………………………………………………………………92

4-3 روش پیشنهادی حل……………………………………………………………………………………………………….94

4-4 مسائل نمونه…………………………………………………………………………………………………………………..99

4-4-1 روش کاروش- کاهن- تاکر……………………………………………………………………………..97

4-5 نتایج محاسباتی……………………………………………………………………………………………………………..99

فصل پنجم : نتیجه گیری و پیشنهادات آتی……………………………………………………………………………106

5-1 نتیجه گیری……………………………………………………………………………………………………..107

5-2 پیشنهادات آتی…………………………………………………………………………………………………108

مراجع………………………………………………………………………………………………………………………………….109

مراجع فارسی…………………………………………………………………………………………………………..110

مراجع لاتین…………………………………………………………………………………………………………….111

فهرست جداول

عنوان                                                                                                         صفحه

فصل دوم :

جدول (2-1). مروری اجمالی بر مسایل مكان یابی تسهیلات در حضور موانع………………………………….8

فصل چهارم :

جدول (4-1). اطلاعات تسهیلات موجود………………………………………………………………………………….93

جدول (4-2). اوزان مابین تسهیل موجود و جدید……………………………………………………………………..3 9

جدول (4-3) . مختصات مکان بهینه تسهیل جدید در مثال نمونه………………………………………………….93

جدول (4-4). مختصات تسهیلات موجود…………………………………………………………………………………99

جدول (4-5). تسهیلات درون و بیرون مسیر دایره ای……………………………………………………………….100

جدول (4-6). نقاط پایداری حاصل ازK.K.T در ترکیب تکی ربع……………………………………………….101

جدول (4-7). نقاط پایداری حاصل ازK.K.T در ترکیب دو تایی ربع ها………………………………………101

جدول (4-8). نقاط پایداری حاصل ازK.K.T در ترکیب سه تایی ربع ها……………………………………..107

جدول (4-9). نقاط پایداری حاصل ازK.K.T در ترکیب چهار تایی ربع ها………………………………….102

 

جدول (4-10). نقاط پایداری حاصل ازمیانه در ترکیب تکی ربع ها……………………………………………102

جدول (4-11). نقاط پایداری حاصل ازمیانه در ترکیب دو تایی ربع ها……………………………………….102

جدول (4-12). نقاط پایداری حاصل ازمیانه در ترکیب سه تایی ربع ها………………………………………102

جدول (4-13). نقاط پایداری حاصل ازمیانه در ترکیب چهار تایی ربع ها…………………………………..103

جدول (4-14). نقاط با تابع هدف مینیمم حاصل ازدو روش در ترکیب تکی ربع ها……………………. 103

جدول (4-15). نقاط با تابع هدف مینیمم حاصل ازدو روش در ترکیب دو تایی ربع ها…………………103

جدول (4-16). نقاط با تابع هدف مینیمم حاصل ازدو روش در ترکیب سه تایی ربع ها………………..104

جدول (4-17). نقاط با تابع هدف مینیمم حاصل ازدو روش در ترکیب چهار تایی ربع ها…………….104

جدول (4-18). مقدار تابع هدف در نقاط حاصل از گام پنجم…………………………………………………..104

فهرست اشكال

عنوان                                                                                                         صفحه

فصل دوم :

شکل (2 -1- 1). نواحی با محدودیت در قرارگیری و یا حركت……………………………………………………..8

شکل (2-2-1) . نوع مانع در نظر گرفته شده توسط کاتز و کوپر……………………………………………………9

شکل( 2- 2- 2) رویکرد در نظر گرفته شده برای حل مسایل مکان یابی با مانع توسط بایشوف و کلامروس……………………………………………………………………………………………………………………………….10

شکل( 2- 2-3)0 رویکرد در نظر گرفته شده برای حل مسایل مکان یابی با مانع توسط کلامروس…….11

شکل (2-2-4) . نوع مانع در نظر گرفته شده توسط آنجا و پارلر…………………………………………………..12

فصل سوم :

شکل (3-1). دسته بندی مسایل برنامه ریزی تسهیلات…………………………………………………………………22

شکل(3-2). فاصله اقلیدسی بین دو نقطه……………………………………………………………………………………25

شکل(3-3). فاصله متعامد بین دو نقطه………………………………………………………………………………………26

فصل چهارم :

شکل (4-1). مانع آرکی شکل احتمالی در صفحه………………………………………………………………………..44

این مطلب را هم بخوانید :

شکل (4-2). وضعیت دو تسهیل در حالت پدیدار نبودن………………………………………………………………46

شکل (4-3). وضعیت دو تسهیل در حالت پدیدار بودن……………………………………………………………….46

شکل (4-4). گام های شرایط پدیدار بودن دو تسهیل نسبت به هم………………………………………………..47

شکل (4-5). شرایط گام اول پدیداری……………………………………………………………………………………….49

شکل (4-6). شرایط گام سوم پدیداری………………………………………………………………………………………53

شکل (4-7) .حالت اول شرایط با مانع جهت آزمون برخورد راستای افق تسهیل جدید با مانع…………..56

شکل (4-8) .ترکیب اول از شرایط با مانع…………………………………………………………………………………..59

شکل (4-9) .ترکیب دوم از شرایط با مانع………………………………………………………………………………….60

شکل (4-10) .ترکیب سوم از شرایط با مانع……………………………………………………………………………….60

شکل (4-12) .ترکیب چهارم از شرایط با مانع…………………………………………………………………………….63

شکل (4-13) .ترسیم خطوط متناظر در حالت تک ریشه………………………………………………………………65

3-4-16- آلکید های غیر خشک شونده……………. ………………………………………………………138

3-4-17- آلکید های با سختی بالا……………. …………………………………….. ……………………..138

3-4-18- ایزوسیانات ها و پلی اورتان ها……………. …………………………………….. ……………138

3-4-19- تولوئن دی ایزوسیانات(TDI) …………….. …………………………………….. ………….139

3-4-20- هگزا متیلن دی ایزوسیانات (HDI) …………….. …………………………………………..140

3-4-21- آمینو رزین (اوره و ملامین) ……………. ……………………………………… ………………142

3-4-22- رزین های پلی استر……………. …………………………………….. …………………………..143

3-4-23- رزین های آکریلیک…………….. …………………………………….. ………………………….144

3-4-24- رزین های آکریلیک ترمو پلاستیک…………….. ……………………………………… …….145

3-4-25- رزین های ونیلی…………….. …………………………………….. ………………………………145

3-4-26- رزین های اپوکسی……………. …………………………………….. …………………………….146

3-4-27- واکنش با آمین‌ها و یا آمید ها (نوکلئوفیل ها) ……………. ……………………………….147

3-4-28- استر های اپوکسی…………….. …………………………………….. …………………………….148

3-4-29- پوشش دهنده های بر پایه آب…………….. ………………………………………… ………..149

3-4-30- آلکید ها و پلی استر های محلول در آب …………………………………………………….150

3-4-31- رزین های آکریلیک محلول در آب………….. ………………………………………………..151

3-4-32- رزین های اپوکسی بر پایه آب……………. …………………………………………………….151

3-4-33- عوامل ضد واکشیدگی……………. …………………………………….. ………………………..151

3-4-34- جذب کننده های UV…………….. ………………………………………………………………152

3-4-35- رنگ‌ها (رنگ دانه ها و رنگ زنی) ……………. ………………………………………………153

فصل چهارم: بحث و نتیجه گیری……………. ……………………………………… …………………………..155

فصل پنجم: فهرست منابع……………. ……………………………………….. …………………………………….159

 

فهرست جدول­ها:

    فصل اول: مقدمه

جدول 1-1- استانداردهای AWPA پیرامون شرایط متفاوت مصرف

فرآورده های تیمار شده………………………………………………………………………………5

جدول 1-2- استانداردهای اروپایی پیرامون شرایط متفاوت مصرف

فرآورده های تیمار شده……………………………………………………………………………..6

جدول1-3- فهرستی از مواد حفاظتی متعارف چوب و برخی از وی‍ژگی های آنها……………….81

    فصل دوم: تاریخچه

جدول 2-1- تاریخچه حفاظت چوب…………………………………………………………………………..14

    فصل سوم: کلیات

جدول 3-1-1-میزان خورندگی فلزات مختلف توسط نفتانات مس بر پایه آب

در غلظت‌های مختلف در مقایسه با مواد حفاظتی دیگر…………………………………42

دول 3-4-1- ایزوسیانات و خواص پوششی آن………………………………………………………..140

جدول 3-4-2- تغییر رنگ ایزوسیانات ها…………………………………………………………………..141

جدول 3-4-3- اجزا ترکیبی و ویژگی آنها در تولید پلی استر………………………………………..144

 

فهرست شکل‌ها:

    فصل سوم: کلیات

 

    3-1- مواد حفاظتی چوب در برابر عوامل بیولوژیک

شکل 3-1-1- نسبت کوات به اکسید مس در ماده ACQ………………………………………………..24

شکل 3-1-2- کواترنری آمونیوم کمپاند(کوات)…………………………… ………………………………24

شکل 3-1-3- بنزالکونیوم کلراید(BAC)………………… …………………………….. ………………….25

شکل 3-1-4- مس قلیایی DCOI (ACD)………………….. …………………………….. ………………29

شکل 3-1-5- مس دوگانه (دی متیل دی تیو کربامید) (CDDC)………………….. ……………….30

شکل 3-1-6- تبوکونازول……………………… …………………………….. …………………………………32

شکل 3-1-7- پروپیکونازول………………… …………………………….. …………………………………..34

شکل 3-1-8- ساختار مولکولی ایمیداکلوپراید………………………………. …………………………….36

شکل 3-1-9- انواع کاپرازل و نسبت ساختار تشکیل دهنده آن…………………… …………………38

شکل 3-1-10- نسبت مواد تشکیل دهنده Copper HDO…………………….. ……………………40

شکل 3-1-11- نفتانیک اسید……………………. …………………………….. ………………………………41

شکل 3-1-12- نفتانات مس (بر پایه آب)……………………… …………………………….. …………..41

شکل 3-1-13- ساختار شیمیایی بورات…………. …………………………….. ………………………….43

شکل 3-1-14- دی سدیم اکتا برات تترا هیدرات………………… …………………………….. ………45

شکل 3-1-15- ساختار شیمیایی تری متیل برات………………….. ……………………………… …….47

شکل 3-1-16- پلیمر بتایین…………………… …………………………….. …………………………………49

شکل 3-1-17- پلیمر بتاین با شکل یون مثبت…………………….. ………………………………………50

شکل 3-1-18- پیوند هیدروژنی بین چوب و DPAB……………………………………………………50

شکل 3-1-19- پنتاکلروفنول…………………. …………………………….. ………………………………….52

شکل 3-1-20- نفتانات مس…………………. …………………………….. ………………………………….54

شکل 3-1-21- نفتانات روی……………….. …………………………….. …………………………………..56

شکل 3-1-22- مس 8 کیونیولات…… …………………………….. …………………………………………57

شکل 3-1-23- IPBC……………… …………………………….. ……………………………………………..58

شکل 3-1-24- ساختار مولکولی پرمترین…………….. …………………………….. …………………….59

شکل 3-1-25- سای پرمترین و شباهت ساختاری با حشره کش‌های شیمیایی…………………..62

شکل 3-1-26- برخی از ترکیبات موجود در محصولات حاوی سای پرمترین…………………..62

شکل 3-1-27- دی دسیل دی متیل آمونیوم کلراید(DDAC)…………………………………………..63

شکل 3-1-28- 4,5-Dichloro-2-N-Octyl-4-Isothiazolin-3-One (DCOI)……….64

شکل 3-1-29- ساختار مولکولی کلروپیریفوس…………….. …………………………………………….65

شکل 3-1-30- تیوسیاناتومتیل تیو بنزوتیازول…………………… …………………………….. ………..66

شکل 3-1-31- ساختار شیمیایی دلتامترین……………… …………………………….. ………………….67

شکل 3-1-32- ساختار شیمیایی بیفترین………………….. …………………………….. ………………..68

شکل 3-1-33- کاربندازیم………………. …………………………….. ……………………………………….70

شکل 3-1-34- کلروتالونیل…………………… …………………………….. …………………………………71

شکل 3-1-35- بنزیمیدازول……………. …………………………….. ……………………………………….72

شکل 3-1-36- واکنش بنزن و ایمیدازول و تشکیل بنزیمیدازول………….. ………………………..72

شکل 3-1-37- واکنش اسیدکربوکسیلیک با آمین‌ها و تبدیل به کربوکسی آمید………………….73

شکل 3-1-38- سای فلوترین…………….. …………………………….. …………………………………….75

شکل 3-1-39- فیپرونیل……………… …………………………….. …………………………….. …………..76

شکل 3-1-40- تولیفلوآنید…………. …………………………….. …………………………….. ……………79

    3-2- مواد و روش‌های حفاظتی سازگار با طبیعت

شکل 3-2-1- وابستگی دوام و مقاومت در تیمار حرارتی……………….. ……………………………93

شکل 3-2-2- ساختار کتین و کایتوزن……………. …………………………….. ………………………..104

شکل 3-2-3- کاربردهای کایتوزن………….. …………………………….. ……………………………….106

شکل 3-2-4- آلفا اسدیسون………… …………………………….. …………………………………………107

شکل 3-2-5- هورمون‌های جوانی………………. …………………………….. ………………………….107

این مطلب را هم بخوانید :

    3-3- کندسوزکننده ها و مواد ضد آتش

شکل 3-3-1- آمونیوم سولفات………. …………………………….. ………………………………. …….117

شکل 3-3-2- آمونیوم فسفات…….. …………………………….. …………………………….. ………….118

شکل 3-3-3- دی آمونیوم فسفات………… …………………………….. …………………………………119

شکل 3-3-4- آمونیوم دی هیدروژن فسفات………… …………………………….. ………………….120

شکل 3-3-5- بوریک اسید……………………… …………………………….. ……………………………..121

شکل 3-3-6- گوانیل اوره فسفات ……………………….. …………………………….. ………………..124

شکل 3-3-7- سدیم سلیکات………………. …………………………….. …………………………………125

    3-4- پرداخت‌های نهایی

شکل 3-4-1- قسمتی از زنجیره نیترات سلولز………. …………………………….. ………………….134

شکل 3-4-2-شماره 1 گلیسرول، شماره 2 پنتا اریترول……………….. ……………………………..135

شکل 3-4-3-شماره 1 ارتوفتالیک اسید شماره 2 ایزوفتالیک اسید…………… …………………..135

شکل 3-4-4- نمایش نموداری ترکیبات آلکید ها………… …………………………………………….136

شکل 3-4-5- مولکول اورتان (اتیل کاربامات) حاصل از واکنش بین اوره با اتیل الکل……..138

شکل 3-4-6- شکل گیری بیوریت (دی ایزوسیانات+ آب)…………………………………………..140

شکل 3-4-7- واکنش ایزوسیانات با آب تولید دی اکسید کربن می‌کند…………………………..140

شکل 3-4-8- واکنش بین اوره و فرمالدئید…………………………………………………………………142

شکل 3-4-9- تولید زنجیره خطی پلی استر از واکنش گروه دی الکل با گروه

دی کربوکسیلیک اسید………… …………………………….. …………………………….. …………………143

شکل 3-4-10- آکریلات (1) و متاکریلات (2) استر………….. ……………………………… ……..145

شکل 3-4-11- مونومر ونیل استات………… …………………………….. ………………………………146

شکل 3-4-12- واکنش گروه اپوکسی با آمین ثانویه…… …………………………….. ………………147

1-21-2 انگل های طیور. 26

1-2-1-21 تک یاخته های موجود در دستگاه گوارش… 26

1-2-21-11- هیستوموناس مله آگریدیس… 26

1-2-21-12- تریکوموناس گالینه. 26

1-2-21-13- کوکسیدیوز در ماکیان. 28

1-2-21-14- کریپتوسپوریدیوم بیلئی و کریپتوسپوریدیوم مله آگریدیس… 29

2-21-2-1 سستودهای مهم موجود در دستگاه گوارش و مدفوع. 30

1-2-21-2-1 داویناپروگلوتینا 30

2-2-21-2-1 رایه تیا تتراگونا 30

3-2-21-2-1 رایه تینا سیستی سیلوس… 31

4-2-21-2-1 رایه تینا اکینوبوتریدا 31

5-2-21-2-1 آمبوتنیا کونه آتا مترادف آمبوتنیا اسفنوئیدس… 32

6-2-21-2-1 هیمنولپیس کانتانینا و هیمنولپیس کاریکا 32

7-2-21-2-1 کوانوتینا اینفاندیبولوم. 33

8-2-21-2-1 فیمبریا فاسیولاریس… 33

9-2-21-2-1 ترماتودها 33

3-21-2-1 ترماتودهای موجود در مدفوع و دستگاه گوارش… 33

1-3-21-2-1 اکینوستومارولوتوم. 33

2-3-21-2-1 اکینوپاریفیوم رکاراتوم. 34

3-3-21-2-1 هیپودرائوم کونوئیدم. 34

4-3-21-2-1 نوتوکوتیلوس اتنواتوس… 35

5-3-21-2-1 کاتاتروپیس وروکوزا 35

 

6-3-21-2-1 پوستار موستوموم کوموتاتوم (پوستار موستوموم گالیناروم) 35

7-3-21-2-1 نماتودها 36

4-21-2-1 نماتودهای موجود در مدفوع و دستگاه گوارش… 36

1-4-21-2-1 آسکاریدیاگالی.. 36

2-4-21-2-1 هتراکیس گالیناروم. 36

3-4-21-2-1 گاپیلا ریا انولتا مترادف اکولئوس انولاتوس… 37

4-4-21-2-1 کاپیلاریاکونتورتا مترادف اکولئوس کونتوراتوس… 37

-4-21-2-15 کاپیلاریا کودین فلاتا 38

6-4-21-2-1 کاپیلاریا ابسیگناتا 38

7-4-21-2-1 تریکوسترونژیلوس تنوئیس… 39

8-4-21-2-1 کاپیلاریا آناتیس (کاپیلدریوز روده باریک) 39

9-4-21-2-1 نماتودهای با اهمیت ثانویه. 40

10-4-21-2-1 دسیفارنیکس اسپیراکیس مترادف (سیفارنکس ناسوتا و اکواریا اپیر رایس) 40

11-4-21-2-1 تترامرس آمریکانا و تترامرس فی سیس پینا 40

12-4-21-2-1 آکواریا نا مولوزا 40

13-4-21-2-1 هترتیا گالیناروم. 41

14-4-21-2-1 سوبولورا برومپتی.. 41

15-4-21-2-1 سوبولورا سکتوریا و سوبولورا دیفرنس… 41

16-4-21-2-1 استرونژیلوئیدس آویوم. 41

فصل دوم. 43

مواد و روش کار. 43

1-2 روش کار. 44

1-2-1 بررسی تک یاخته های حلق و چینه دان. 44

این مطلب را هم بخوانید :

1-2-2 بررسی تک یاخته های موجود در مدفوع و محتویات روده 44

1-2-3 رنگ آمیزی زیل نلسون. 45

1-2-4 بررسی آلودگی انگلی دئودنوم. 45

1-2-5 بررسی آلودگی کرمی دستگاه گوارش… 45

1-2-6 تهیه مقطع میکروسکپی ازسکوم. 46

فصل سوم. 47

نتایج.. 47

3-1 نتایج.. 48

فصل چهارم. 49

بحث و نتیجه گیری.. 49

4-1 بحث و نتیجه گیری.. 50

 

اشکال